淡水渔业

2020, v.50;No.345(01) 31-37

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摄食不同种类饵料的鲤肝脏组织miRNA表达谱分析及验证
Analysis and validation of miRNA expression profiles in liver of Cyprinus carpio feeding with different types of diets

罗杰;杨淞;杜杰;刘巧;杜宗君;杨世勇;李胜杰;赵柳兰;

摘要(Abstract):

MicroRNA(miRNAs)是一类长度为18-25nt的内源性非编码单链小RNA,参与细胞增殖与凋亡、免疫、脂肪代谢等过程。本试验以三组投喂不同类型饵料的鲤(Cyprinus carpio)肝脏为研究材料,通过HiSeq 2500深度测序技术和生物信息学分析miRNA,鉴定出235个已知miRNAs。三种饵料组共表达的差异miRNAs有13个,随机挑选5个miRNA并采用qPCR进行验证,表达趋势在qRT-PCR结果和RNA测序结果中高度相似;对13个共表达的差异表达miRNAs进行靶基因预测,共预测到靶基因530个。对预测靶基因进行KEGG通路分析,结果显示参与2-羰基羧酸代谢,糖基磷脂酰肌醇(GPI)-锚定生物合成,柠檬酸循环(TCA循环)等通路的调节。本研究首次了解鲤摄食不同种类饵料的miRNAs表达特征,可以为深入了解miRNA对鲤摄食不同种类饵料过程的调控作用奠定基础。

关键词(KeyWords): 鲤(Cyprinus carpio);miRNA测序;饵料;肝脏;差异表达miRNA

Abstract:

Keywords:

基金项目(Foundation): 国家大宗淡水鱼产业技术体系建设项目(CARS-45-04);; 中国水产科学研究院院本级基本科研业务费专项

作者(Author): 罗杰;杨淞;杜杰;刘巧;杜宗君;杨世勇;李胜杰;赵柳兰;

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